Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAPO00193 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAPO00193 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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