Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms