Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms