Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMFRQ9UKV5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms