Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms