Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms