Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms