Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC1Q9NRX5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms