Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms