Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms