Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms