Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms