Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms