Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL13Q99616 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms