Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms