Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC7Q96M83 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms