Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms