Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ELP4Q96EB1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELP4Q96EB1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms