Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C18orf8Q96DM3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C18orf8Q96DM3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C18orf8Q96DM3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C18orf8Q96DM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C18orf8Q96DM3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C18orf8Q96DM3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms