Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP4CQ96CF2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms