Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH0

NABP1, SOSS complex subunit B2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP1Q96AH0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NABP1Q96AH0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms