Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFKQ969G6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms