Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CHCHD4Q8N4Q1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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