Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms