Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms