Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms