Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FGD6Q6ZV73 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms