Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms