Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms