Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLX4IPQ5VYV7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms