Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCERG1LQ5VWI1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCERG1LQ5VWI1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms