Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF20Q5VTR2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms