Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms