Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms