Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms