Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMPD4Q14CM0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms