Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIXQ14938 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIXQ14938 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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