Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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