Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSHL1Q14406 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms