Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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