Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGRF1Q13972 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGRF1Q13972 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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