Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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