Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIGQ13278 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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