Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SEMA3BQ13214 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SEMA3BQ13214 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SEMA3BQ13214 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SEMA3BQ13214 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SEMA3BQ13214 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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