Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRAF2Q12933 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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