Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms