Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms