Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms