Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms