Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX6P78412 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX6P78412 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX6P78412 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX6P78412 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX6P78412 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX6P78412 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX6P78412 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX6P78412 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX6P78412 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX6P78412 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX6P78412 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms