Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms